中国去睡觉的同时,日本海军的扩军工作仍在有条不紊地进行着。
1885年,日本废除了太政官制度,改行内阁制。伊藤博文出任首届总理大臣,首任海军大臣由萨摩出身的西乡从道担任,长州出身的山县有朋为内务大臣,井上磬为外务大臣,大山岩 为陆军大臣。新内阁中,长州和萨摩藩出身者各4人,均占据要职,日本的藩阀政治至此达到极致。此时海军的军令机关仍隶属于参谋本部。到了三年之后的1888年,即北洋海军成军之年,参谋本部海军部改为海军参谋本部,隶属于海军大臣之下。
在19世纪70年代,清日两国曾同时派员赴欧洲考察军事。中国咨询船炮机械,日本则考察军事学校教育。德国首相俾斯麦为此曾深有感慨地预言:“日本其兴,中国其弱乎!”明治维新一开始,日本便十分重视对西方军事科学的引进将它看作是“文明开化”的一个重要组成部分。明治时代的军事改革家认为,更新官兵头脑中的指示,与更新他们手中的武器同样重要。如前文所述,在短短的十多年间,日本陆海军便建立起系统的近现代军事教育体制,使将、佐、尉三级军官普遍受到军校的正规教育。
为了培养参谋军官和高级将领,日本又于1883年在东京建立了陆军大学,并从德国总参谋部聘请了陆军少将麦克尔(Klemens W. J. Meckel)等人来日本,教授兵学、军制、参谋演习等课程。专门培养海军将领和参谋的海军大学于1888年在东京目黑区成立,首任校长为当年云扬号事件的主角井上良磬海军少将。
1893年明治天皇发出《和衷共同》的诏敕后,日本国会同内阁之间实现了政治休战,顺从地批准了海军提出的七年造舰预算案(1893年至1899年)。日本海军连忙向阿姆斯特朗公司订购“吉野”号的准姐妹舰,23.5节的高速防护巡洋舰“高砂”号。此时,世界上第一艘近代意义上的战列舰“君权”号(HMS Royal Sovereign)已经在英国问世,它在中轴线上布置前后两座主炮塔,宣告了旧式铁甲舰已经成为过时的玩具。于是日本海军连忙又请英国设计师马可罗(G. C. Macrow)为其设计两艘战列舰,即后来的“富士”、“八岛”号。但是它们还没有开工,中日战争就爆发了。